三ヶ日町農協の出荷する三ヶ日みかんは、生鮮食品では日本で初めて2015年に「機能性表示食品」として受理されました。この機能性成分が「β-クリプトキサンチン」です。β-クリプトキサンチンはガンに対する作用、糖尿病に対する作用、骨粗しょう症予防に関する作用、痴呆に関する作用などの研究がされています。また、糖度の高いミカンほど多く含まれる相関性が報告されています。